遠い昔、人間、神仏と妖魔が一つの世界で平和に暮らしていた。
 
しかし、世界の資源が欠乏するに伴い、
 
争いは妖魔と神仏の間で拡大し、やがて最大規模の【滅世戦争】にまで発展した。
長く続けた戦争によって、
怨念が蔓延し、さらに強い妖魔や神仏の魂が徘徊していた。
 
そこで、人間界の中に「陰陽師」と呼ばれるものたちが誕生した。
 
世界の秩序と繁栄を回復するために、
彼らは世界各地で現れた強き妖魔と神を封印する他たびに出掛けた！