スキルは強力な武器となり、進めていくのに重要な要素となります。スキルには大きく分けて3種類あります。スキルポイントの割り振り方も、勝敗の大きな要因となるでしょう。

各宇宙船は最多で2つの兵器スキルを装着できます。兵器スキルは皆、攻撃系のスキルであり、発動させるにはそれに合う武器が必要です。また、スキルを開放するにはそのスキルに応じた艦長レベルが必要となります。
| 必須艦長レベル | 開放スキル |
|---|---|
| Lv1 | 砲撃、快速射撃 |
| Lv30 | 致死打撃 |
| Lv35 | 攪乱 |
| Lv37 | マルチショット |
| Lv39 | 反陽子パルス |
| Lv40 | 一斉射撃 |
| Lv42 | パルス |
| Lv50 | ライトストーム |
| Lv51 | 抑制フォース |
| Lv60 | パンドラの箱 |
| Lv61 | ディスラプター射線 |
| Lv66 | 反陽子ストーム |
| Lv70 | 電磁パルス |
| Lv75 | タイタンの矢 |
| Lv78 | 収束ビーム |

宇宙船はそれぞれ1~2つの宇宙船スキルを所有できます。その多くは補助系スキルです。
また、宇宙船によって、所有できるスキルが異なります。
| 必須艦長レベル | 開放スキル |
|---|---|
| Lv1 | 集中 |
| Lv12 | 防壁強化 |
| Lv14 | エネルギー回収 |
| Lv30 | 装甲ブースト |
| Lv34 | 高速化 |
| Lv38 | パルスノヴァ |
| Lv46 | 庇護フィールド |
| Lv56 | リセット |
| Lv70 | 包囲モード |

魚雷スキルは攻撃系スキルです。発動させるには宇宙船のスキルに合う魚雷を装着しなければなりません。一隻の宇宙船に魚雷スキルを1つしか装着できません。スキル発動の際、弾薬が消耗されます。弾薬はクリスタルで補充できます。
※上記内容は開発段階のものです。スキル名や画像が変更される場合が御座います。